Se todas as suas instalações do Windows 10 forem da mesma versão e atualizadas, estou surpreso de que você as veja, já que não há mais Pause Sync:
On Windows 10 Technical Preview build 9926, there is no option to pause OneDrive as we had in earlier version of Windows.
Basicamente, o método mais fácil é sair do OneDrive (por meio do ícone da bandeja ou semelhante) e, em seguida, iniciá-lo novamente quando quiser iniciar a sincronização novamente.