Dado que a fonte de alimentação gera um pouco de calor, colocá-lo em ou pelo menos para o topo parece mais sensato e todas as torres que vi em anos fazem isso.
Por outro lado, eles pesam um pouco, então colocá-los no fundo seria mais estável.
Eu sempre os tive no topo ou perto do topo por anos.
E os ventiladores na PSU devem soprar para fora e não sugá-los. Há várias razões para isso: você não quer que o calor da fonte de alimentação entre no gabinete e não quer que a poeira de fora seja puxada pelo PSU.
Você deseja obter um gabinete que permita grandes ventiladores que podem ser executados mais lentamente (portanto mais silenciosos), algum tipo de tecido ou filtro de espuma pode ser útil se você estiver em um ambiente empoeirado, mas você deve aspirar os ventiladores regularmente para manter o máximo de resfriamento - meu filho está atualmente fazendo seu PC da torre de jogos mensalmente. Se você puder, aspirar internamente uma vez a cada 6-12 meses manterá o interior claro também.
Geralmente, os fãs correm de frente para trás, sugando a parte da frente e soprando atrás. Um erro bastante comum é ter os ventiladores dianteiros e traseiros soprando para dentro ou para fora.