Eu finalmente encontrei uma correção para isso de: o mouse não responde quando o computador está ocupado p>
Resposta de VeganCaramels trabalhada:
Start > Run > msconfig > click Boot tab > click Advanced Options > make sure "Number of processors" shows the number of cores your processor actually has (change it to the correct number if it's wrong)
Eu tenho o processador Intel i5-520M dual core, então eu configurei o "Número de processador" para 2. Os problemas desapareceram imediatamente após a reinicialização. Meu computador também acelerou significativamente, por exemplo, a pesquisa do Eclipse agora é pelo menos 2-3 vezes mais rápida para a mesma base de código.
Eu suspeito que isso tenha a ver com algum bug no suporte do Hyperthreading, eu o habilitei no BIOS para fins de VirtualBox.