Eu tenho experimentado isso também e não me preocupei em persegui-lo até agora. Eu descobri rapidamente essa questão no projeto BashOnWindows, que pelo menos para mim resolveu o problema. Eu tenho uma linha set -s escape-time 0
no meu arquivo .tmux.conf e comentando (ou renomeando meu arquivo .tmux.conf para que ele não seja carregado) resolvi o problema.