Pode ser que o gerenciador de energia do laptop esteja decidindo que o carregamento acima de 87% será prejudicial à vida útil da bateria. Também pode ser que a nova bateria ainda não esteja calibrada e, por isso, ela é 100% carregada, embora esteja exibindo apenas 87%.
Você não está reportando nenhum problema real (como a baixa duração da bateria) para que seus problemas pareçam puramente estéticos. Use a bateria durante um ciclo completo ou dois e você provavelmente descobrirá que não há problema algum.