Se os dados estiverem formatados como uma tabela do Excel (selecione qualquer célula dentro do intervalo e escolha Inserir -> Tabelas - > Tabela), passe o mouse sobre o topo de uma célula na linha de cabeçalho. O ponteiro mudará para uma seta apontando para baixo. Clique e você selecionará a coluna inteira. Em seguida, clique com o botão direito e escolha Excluir - > Linhas de Tabela.
Dessa forma, você exclui todo o conteúdo da sua tabela, mas não perde a formatação da tabela, incluindo os filtros.