A macro Shell tem muito em comum com a função ShellExecute WinAPI . Portanto, open , print e outros têm o mesmo significado que lpOperation argumento da função.
Alternativamente, o primeiro argumento da Shell aceita os new_console switches internos do ConEmu, sem o mínimo possível.
Em seguida, o ConEmu não expande os nomes das variáveis para seus valores quando executar Shell function. Você pode verificar isso facilmente com Process Explorer executando cmd em vez de explorer . Exemplo:
Shell("open","cmd","%CD%")
Quando você executa Shell("open",...) ConEmu não herda o ambiente. Mas quando você especifica new_console:I em vez de open , isso acontece. Portanto, no exemplo do site CD é "herdado" corretamente.
Por fim, você não citou %CD% corretamente em seu primeiro exemplo. Isso realmente não importa (também não funcionaria), mas a notação correta seria ..., "\"%CD%\"") , o mesmo que no exemplo do site.