No Notepad ++ 6.9.1 eu consegui fazer isso selecionando Search- > Replace ... e colocando a seguinte expressão regular no campo "Find what:":
(^[^<>\n]+)\n|\n[^<>\n]+
Em seguida, deixe o campo "Substituir com:" vazio e defina um Modo de pesquisa de "Expressão regular", deixando ". matches newline" desmarcada e pressionando "Substituir tudo".
Como funciona
(^[^<>\n]+)\n|\n[^<>\n]+ é uma Expressão regular do Notepad ++ .
(^[^<>\n]+)\n É uma subexpressão que corresponde a linhas que não começam com < ou > . Isso corresponde à primeira linha do texto na sua entrada de exemplo "bsg23".
| Indica alternância entre duas subexpressões
\n[^<>\n]+ Corresponde a uma nova linha seguida por caracteres que não são < , > ou uma nova linha. Isso corresponde às novas linhas no final das linhas que começam com < ou > e o seguinte texto na próxima linha.