Entre em um console de recuperação com um disco de instalação para inspecionar seu sistema. Tente o seguinte:
- Verifique se há erros de disco com
chkdsk /f C:
- Reconstruir dados de configuração de inicialização
bootrec /RebuildBCD
- Corrigir o registro mestre de inicialização
bootrec /fixMbr
- Corrigir o setor de inicialização
bootrec /fixboot
- Reparar partições
bootsect /nt60 ALL
Se você tentar reinstalar o Windows, verifique a integridade do disco.
P.S. É uma boa ideia fazer o flash da BIOS com o firmware mais recente. Embora seja raro, um minúsculo rootkit pode se instalar no BIOS. Piscando com se livrar dele. Se você já tem a mesma versão, pode ser necessário forçar o flash.