Se o SSD estiver bom, e os acionamentos mecânicos forem afetados, acho que pode ter a ver com a unidade de fonte de alimentação. PSUs ruins podem fritar seu hardware.
Os SSDs e os drives mecânicos são conectados usando o mesmo conector SATA para dados, e o mesmo protocolo é seguido para transmissão de e para um SSD e drive mecânico.
A diferença possível pode ser o consumo de energia dos dois tipos de inversores e sua resposta a flutuações de energia.
Infact , lembro-me de uma vez em 2010/2011 quando levei um computador com um PSU ruim para reclamação de garantia e eles erroneamente diagnosticaram meu disco rígido como defeituoso (que não era na garantia). Eu trouxe para casa o computador e ele arrancou bem. Eu substituí o PSU e usei o mesmo disco rígido por mais 3 anos até vender o computador! Não estou dizendo que é o mesmo caso com você, mas há uma grande possibilidade.