Isso ocorre porque seu usuário de FTP não é root. O servidor FTP não sabe que você tem permissão para fazer isso, e o protocolo FTP não tem um mecanismo para enviar uma solicitação su
.
Uma solução alternativa é fazer o upload da pasta com o usuário normal, mas para o diretório inicial dos usuários. Em seguida, você faz o shell in e sudo su
e, em seguida, copia a pasta para onde realmente deseja. Certifique-se de chown
da pasta para o proprietário correto depois, tho.
Sua abordagem de alteração da permissão para 775
poderia funcionar, desde que seu usuário seja o mesmo grupo de quem possui a pasta para a qual você está enviando.
PS: Por causa da segurança, você geralmente não quer permitir que as pessoas façam login como root diretamente, seja via FTP ou SSH.