Eu não acho que isso seja possível com diff
sem modificações no código. Você precisará usar find
para listar os arquivos necessários, os quais você poderá passar para diff
sem recursão:
find /var/ -type f -exec diff {} /media/mateusz/Database/tmp/duplicity_unpack{} \;
Isto encontra apenas arquivos normais, já que não vejo sentido em chamar diff
com qualquer outro tipo, então não há sockets, FIFOs, diretórios, arquivos de dispositivos, etc.