Da GUI:
Ctrl + A
selecionará todos os itens em uma pasta.
Usar Ctrl + Left click
nos itens atualmente selecionados desmarcará APENAS o item.
Usar Shift + Left click
irá "recolher" a seleção do topo da lista de pastas para o item que você clicou. Tudo abaixo desse item não será mais selecionado.
Há um monte de teclas de atalho semelhantes a esta disponíveis no Windows, que são sempre legais e ajudam. Você pode encontrar a lista aqui: