A full explanation is posted here: Why is dnsmasq adding ISP DNS servers to a VPN connection and how do I stop it? by danielkza.
O NetworkManager usa um encaminhador DNS local usando o dnsmasq por padrão. Em Nesse caso, ele configura um "DNS dividido", onde apenas as consultas para os domínios pertencente ao espaço da VPN vai para o DNS da VPN, e outros são direcionados para onde eles iriam se nenhuma VPN estivesse sendo usada ( fonte )
Se você quiser eliminar esse comportamento e ter o DNS VPN usado em Em todos os casos, você deve desativar o encaminhador local removendo / comentando a linhadns=dnsmasq
em/etc/NetworkManager/NetworkManager.conf
, em seguida, recarregando / reiniciando Gerente da rede.