Eu tive o mesmo problema, mas encontrei a solução.
Depois de alternar para o botão esquerdo (nas preferências > mouse), você deve executá-lo no terminal para mapear os toques do touchpad corretamente
manolo@manolo-TravelMate-5720:~$ synclient TapButton1=3
manolo@manolo-TravelMate-5720:~$ synclient TapButton2=1
Agora, apenas programe essas linhas para executá-las sempre que Lubuntu for iniciado.