Consegui resolver um problema semelhante alterando as opções do eixo para:
- Limites: Mínimo 0,5
- Unidades: 1 menor
- Cross Crosses em: Axis Value 0.0
- Número > Catagory > Número > Casas decimais = 0
Desta forma, o eixo começa mostrando para um número > = 1, e o chão aparece em branco para qualquer valor abaixo disso - no meu caso, não exibir os valores 0 em um gráfico 3D.