Tente digitar unity --reset
em um terminal.
Descobri que esse comando não funciona mais, mas há outra maneira de redefinir o Unity.
Primeiro de tudo, instale o dconf-tools: sudo apt-get install dconf-tools
Então, para redefinir Unity e Compiz:
dconf reset -f /org/compiz/
seguido por
setsid unity
Espero que isso ajude.