Se você puder conectar sua placa-mãe e seu sistema 5.1 digitalmente via spdif ou hdmi, recomendo deixar a placa de som extra para fora. Dessa forma, você mantém sua configuração simples e é menos provável que tenha problemas de compatibilidade e seu sistema consome menos energia.
Se o sinal for transmitido digitalmente, o seu sistema 5.1 processará a conversão digital-analógica, o que significa que a qualidade do som dependerá quase exclusivamente do seu sistema 5.1 e não da placa de som.
Os argumentos para deixar o cartão são se você conectar o sistema 5.1 através de uma conexão analógica e a qualidade do som estiver melhor ali, ou se você jogar jogos que suportem efeitos sonoros melhores com o cartão extra.