Dentro das configurações de energia (pelo menos no Windows, não tenho certeza sobre o seu Ubuntu), você pode definir o comportamento do notebook quando a tampa é fechada. Por padrão, ele entrará no modo de suspensão (também conhecido como modo de economia de energia).
Parece que o modo de suspensão não está funcionando corretamente no seu sistema. Portanto, você pode querer alterar as configurações de energia para não fazer nada quando a tampa estiver fechada. No entanto, certifique-se de que o sistema não permaneça ligado e esteja esgotando a bateria.
Existe uma postagem relacionada que se refere a um script para "verificação de tampa" contra despertar indesejado do modo de salvaguarda com tampa fechada.
O problema do congelamento na suspensão é discutido aqui . Parece um problema de kernel ou driver .