O Nautilus-the-file-browser é inteligente o suficiente para perceber que você está renomeando uma pasta "especial" ("Downloads" no seu caso) e ajusta suas configurações para usar o novo nome.
As configurações são armazenadas no arquivo $HOME/.config/user-dirs.dirs
- você pode editá-lo ou apenas fazer algum truque com a renomeação de seus Downloads2 atuais para Downloads via Nautilus.
Em seguida, você pode mover o conteúdo de lá para uma partição separada e montar essa partição como $HOME/Downloads
.
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