Uma conversão sem perder suas partições é possível, mas seu sistema não será inicializável depois de fazer essa alteração. O meu próprio fdisk GPT ( gdisk e programas relacionados) pode fazer isso, e acredito que algumas ferramentas comerciais de terceiros do Windows podem faça isso também. O Windows vincula seu modo de inicialização ao tipo de tabela de partição do disco de inicialização; O Windows pode inicializar discos MBR somente no modo BIOS e discos GPT somente no modo EFI. Assim, fazer essa conversão exigirá a instalação de um carregador de inicialização no modo EFI para o Windows. Além disso, seu computador deve ter o firmware EFI, que estava ausente na maioria dos computadores antes de meados de 2011. Existem sites descrevendo como fazer a conversão e instalar um gerenciador de inicialização adequado, mas não tenho URLs disponíveis no momento.
É quase certo que seja mais fácil instalar o Fedora no seu disco MBR. Se você tem menos de quatro partições primárias no momento, você pode fazer isso facilmente redimensionando suas partições existentes para criar espaço e instalar o Fedora inteiramente em partições lógicas. ( NÃO crie partição (ões) para o Fedora usando as ferramentas do Windows, porém, isso provavelmente criará novos problemas.) O Fedora lida bem com a instalação inteiramente em partições lógicas. Se você já tem quatro partições primárias, você deve excluir uma ou convertê-la do formato primário para o lógico. O último pode ser realizado com meu programa FixParts ou com algumas ferramentas do Windows de terceiros. Não converta qualquer partição inicializável do formato primário para o lógico; faça essas conversões apenas em partições de dados.