Isso geralmente ocorre se você se conectar ao mesmo servidor de dois computadores diferentes com resoluções diferentes. Por exemplo, uma área de trabalho com 1920x1080 e um notebook com 1280x1024.
Esta configuração de GPO deve impedir que os atalhos da área de trabalho sejam reorganizados:
Localização da política: Configuração do usuário > Políticas > Modelos Administrativos > Desktop
Configuração: não salvar configurações ao sair
Registry Key: HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer
Registry Value: NoSaveSettings