Da saída de ls -lhd * , parece que você não é o proprietário dos diretórios em questão e não tem permissões de acesso a eles. Você pode corrigi-los simplesmente executando o seguinte comando:
sudo chown YourName *
no diretório que contém os arquivos inacessíveis. Se o mesmo problema ocorrer nos diretórios dentro dos diretórios acima, use em vez disso, sempre no mesmo diretório:
sudo chown -R YourName *
Se isso não funcionar, é por causa de como você montou o disco, mas vamos atravessar essa ponte quando chegarmos lá.
EDITAR:
Hora de atravessar a ponte. Você terá que montar o disco com as permissões read e write . Isso é feito, no Unix (no Linux é um pouco diferente):
sudo mount -u -w /Volumes/YourDriveName
Agora, o comando chown deve funcionar.