Você deve estar bem. Não há capacidade de desativação no Windows. Após a instalação, o Windows solicitará que você ative novamente. A Microsoft e o Windows são inteligentes o suficiente para examinar seu hardware e ver que é o mesmo e usar a mesma chave deve funcionar. Absoluto pior caso, você teria que chamá-los e dizer-lhes que você está mudando para a versão de 64 bits.