Para verificar a versão do OpenGL,
glxinfo | grep "OpenGL version"
Você receberá a saída da seguinte forma,
glxinfo | grep "OpenGL version"
OpenGL version string: 1.4 (2.1 Mesa 7.7.1)
Editar:
Você pode ter mais sorte com o OpenGL moderno, apenas usando "versão" em vez de "versão OpenGL", dadas as diferenças entre os perfis core e compat, bem como as várias versões GLSL e GLES:
glxinfo | grep 'version'
server glx version string: 1.4
client glx version string: 1.4
GLX version: 1.4
Max core profile version: 4.1
Max compat profile version: 3.0
Max GLES1 profile version: 1.1
Max GLES[23] profile version: 3.0
OpenGL core profile version string: 4.1 (Core Profile) Mesa 11.1.2
OpenGL core profile shading language version string: 4.10
OpenGL version string: 3.0 Mesa 11.1.2
OpenGL shading language version string: 1.30
OpenGL ES profile version string: OpenGL ES 3.0 Mesa 11.1.2
OpenGL ES profile shading language version string: OpenGL ES GLSL ES 3.00
Observe que a versão atual é apresentada pela "versão do perfil principal" (4.1), enquanto a "versão do OpenGL" é apresentada como 3.0.