Eu fiz a mesma coisa na minha caixa dev do Windows 7 e obtive exatamente o mesmo erro. Eu estou pensando que é um problema com o atual toolchain android dev - não um problema do sistema operacional.
Acabei de criar um arquivo de texto vazio com esse nome no diretório listado e o erro desapareceu. Como o sdkmanager ainda tem acesso aos repositórios aparentemente sem problemas, estou assumindo que é um arquivo opcional para adicionar novos repositórios ??? seu palpite é tão bom quanto o meu!
Já faz um tempo desde que eu tenho o Ubuntu, mas eu acho que você pode resolvê-lo da mesma maneira simplesmente com:
touch ~/.android/repositories.cfg
não precisa de sudo.