O WinSCP fornece meios convenientes para editar um arquivo do servidor e salvá-lo novamente no servidor. (basicamente faça o download > edite > carregue).
O WinSCP não é um IDE (Integrated Development Environment) como o Eclipse ou o NetBeans. Então você não pode testar seu código, etc, antes de salvá-lo de volta no servidor.
FWIW, adoro o WinSCP, mas não o editor próprio. Par WinSCP com Sublime Text 3 para uma combinação muito poderosa. Teve alguma paciência para configurá-lo do jeito que você quer, mas depois de ter os dois trabalhando juntos, é uma combinação difícil de superar (IMO.)