Como é possível instalar e executar aplicativos do Windows com o Wine, isso geralmente não é necessário, e também pode levar a instabilidades devido a uma compatibilidade com 100% (consulte Wine database para problemas de compatibilidade ).
Muitos programas do Windows têm suas contrapartes nativas do Linux, e eu recomendo strongmente pesquisá-los antes de decidir desistir e usar um programa do Windows com o Wine. Com tanta frequência, você também pode descobrir que simplesmente não precisa instalar nenhum aplicativo adicional, porque o Ubuntu já tinha a melhor opção para você.
Um bom lugar para pesquisar é o Ubuntu Software Center, mas também temos muitas perguntas aqui para dar conselhos sobre aplicativos para substituir as contrapartes do Windows. Para uma recomendação do gerenciador de downloads, consulte:
Você logo descobrirá que os aplicativos fornecidos pelos repositórios do Ubuntu se integrarão perfeitamente à área de trabalho, ou seja, você poderá selecionar facilmente qualquer um desses aplicativos para ações padrão, como fazer download ou abrir um determinado tipo de arquivo.
Este não será o caso das aplicações Wine. Caso você realmente precise de um aplicativo do Windows para uma determinada tarefa, nós temos que defina manualmente um arquivo .desktop para anunciar este aplicativo ao sistema. Para fazer isso, veja a seguinte pergunta: