Depende do que está corrompido no arquivo do usuário. A maior parte do arquivo do usuário é passada para o novo sistema operacional, portanto, é mais do que provável que a corrupção seja propagada para o Win8. O que eu faria, na sua situação, é criar uma pasta 'todos os usuários' e mover todos os seus arquivos para ela (que você deseja manter), e então criar um novo usuário nessa máquina, e colocar todas as suas coisas onde você eu quero isso. Então você pode excluir o usuário corrompido. Depois que o nome de usuário corrompido for excluído, você poderá renomear o novo para o nome antigo.