Eu nunca vi isso acontecer, e isso não faria qualquer sentido - como você poderia substituir um controlador quebrado sem colocar em risco os próprios dados que foram comprados para proteger?
Mas se a revisão do BIOS for diferente, os nomes de volume criados pelo RAID poderão ser diferentes. Se você tiver acesso aos discos, tente inicializar algo como o RescueCD e observe os nomes dos volumes. Se eles são diferentes, então você tem pelo menos algumas de suas respostas. Quem programou a ROM pode ter cometido um erro de digitação?
Em qualquer caso, eu nunca usaria controladores como esse, e isso me deixa um pouco preocupado em ler algo assim. Eu poderia trocar alguns discos por volta de segunda-feira ...