Se você quiser apenas backup com nomes diferentes, poderá usar o tempo de data (com segundos) em vez de um número.
# mkdir somefolder
# touch somefolder/data
# date
Tue May 6 05:40:32 WIB 2014
# cp somefolder/data somefolder/data.$(date "+%s")
# ls somefolder/
data
data.1399329674
# date
Tue May 6 05:41:24 WIB 2014
# cp somefolder/data somefolder/data.$(date "+%s")
# ls somefolder/
data
data.1399329674
data.1399329686
Para automatizar o backup, você pode usar um comando de linha como este
while true; do cp somefolder/data somefolder/backup/data.$(date "+%s"); sleep 3; done
A frase sleep 3
significa que o script deve aguardar 3 segundos antes do backup novamente.