Não. Na verdade, você está melhor com o acesso SFTP.
Há scenarious onde o FTP da velha escola é o preferido, mas eles não parecem aplicar no seu caso. Você estará bem com o acesso SFTP.
EDITAR: Para uma resposta mais completa, precisamos distinguir entre os protocolos FTP e SFTP e o software do servidor usando esses protocolos, e. g. openssh e proftpd.
Se estamos falando sobre os protocolos, há um único caso de uso em favor do FTP. Ou seja, você requer o menor uso de largura de banda possível com acesso anônimo. O protocolo FTP permite acesso anônimo (muito parecido com o http) e tem uma sobrecarga muito pequena, permitindo assim maior carga útil por pacote enviado (muito parecido com o rsync). Se você precisa apenas de acesso anônimo, use http ou talvez WebDAV. Se você quiser apenas uma pequena sobrecarga, use o rsync. Caso contrário, não há motivos para eu não usar o SFTP.
Se estamos falando de servidores, há boas razões para usar o proftpd (ou outros ftpds) sobre o openssh. Embora o openssh ofereça recursos suficientes para tornar seguro, o acesso de negação de shell para SFTP usa possíveis ftpds completos, oferecendo mais recursos que você pode desejar, como suporte a cotas, otimização de largura de banda ou autenticação não baseada no usuário do sistema.