Você diz que copiou os arquivos JPEG com novos nomes.
Se os novos nomes forem substancialmente mais longos que os antigos,
então os novos diretórios (os subdiretórios de “B”)
será maior que os diretórios antigos (os subdiretórios de “A”).
(Sim, os diretórios ocupam espaço e du
conta esse espaço.)
Seu tamanho delta (74809644412 - 74778240380) é 31404032, que é aproximadamente 1000 × 31404.
Isso é consistente com cada um dos subdiretórios 1000 obtendo 31404 bytes maiores (em média).
Se cada um dos nomes dos arquivos 3500 JPEG tiver nove caracteres a mais (em média), isso será feito.