Não, essas configurações não podem ser alteradas na configuração padrão . O Krunner e o Kickoff são projetados para exibir sugestões de pesquisa após pelo menos três letras na entrada. Então, você não pode alterá-los porque não há opção de configuração para fazer isso.
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Veja este artigo da Wikipédia sobre o Krunner.
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Veja também esta documentação em userbase.kde.org que diz, krunner requer pelo menos 3 letras para ser digitado para corresponder a uma pesquisa parcial.
Um relatório de bug foi arquivado contra esse comportamento em link , embora o status ainda não esteja confirmado, a primeira resposta foi
As Plasma developers (somehow understandable) won‘t remove the 3 letters restricton, at least make it more obvious that it won‘t search bevore you‘ve entered at least 3 letters
Então, parece que os desenvolvedores do KDE não estão dispostos a mudar esse comportamento. Eu acho que a única opção é mudar você mesmo e depois recompilar.
Note que tanto o Krunner quanto o Kickoff foram projetados dessa maneira