Não tenho certeza se isso é um problema. shutdown -h
significa que você deseja pelo menos parar e o sistema decide se deve desligar ou não (consulte a man page para o encerramento). -H
significa que você deseja parar, e -P
significa que você deseja que o sistema seja desativado.
Se você não quiser ou não puder alterar os comandos em seus scripts ou qualquer outra coisa, talvez queira tentar esta resposta .