Se o último caractere em um caminho de campo de vários níveis for uma barra, isso indica que o nome anterior era um diretório, não um arquivo. Se você realmente quer que index.php represente um diretório e não um arquivo, então você teria que criar um diretório com esse nome em seu servidor. Então, o htaccess poderia ser modificado para omitir * .php como um tipo de arquivo, e você poderia usar mal outra extensão de arquivo como um tipo de página da web padrão.
Basicamente, não é uma boa ideia. Talvez, se você explicar o que está tentando fazer depois de adicionar uma barra ao nome do arquivo, alguém possa oferecer uma alternativa melhor.