Experimente make -f Makefile.tpl install .
Torne o padrão usar Makefile e makefile e não perceberá que Makefile.tpl é o arquivo do qual você quer que ele tire regras, a menos que você o informe com a opção -f .
Em geral, no entanto, um arquivo * .tpl será um modelo. Eu esperaria algum tipo de etapa de configuração para expandir o modelo para seu sistema específico e gerar um Makefile (sufixo no .tpl) como resultado.