Apenas para informação - desde que você já tenha o arquivo.
Todos os pacotes deb que você baixou devem estar ainda no seu arquivo de pacotes (a menos que você tenha sido muito diligente e tenha limpado o seu arquivo de pacotes!)
Seu arquivo de pacotes está em /var/cache/apt/archives
Assim, para a minha versão do gnome-shell (estou usando 32 bits), eu extrairia o arquivo gnome-shell.css diretamente do arquivo deb do archive, ou seja,
cd ~/Downloads
dpkg --fsys-tarfile /var/cache/apt/archives/gnome-shell_3.2.1-0ubuntu1_i386.deb | tar -xf - ./usr/share/gnome-shell/theme/gnome-shell.css
i.e. você passa o caminho + nome do arquivo como um parâmetro como mostrado (todos os caminhos são relativos, então é ./usr/...
em vez de /usr/...
)