Q1 Sim, ele oferecerá a você uma escolha. No entanto, o BIOS determina o primeiro dispositivo de inicialização e o instalador do Windows detectará isso e colocará um carregador de boot nesse dispositivo, independentemente do que estiver nele. A melhor opção é desconectar todos os outros HDD e SDD e instalar janelas
Q2. Não, você não, o instalador vai lidar com isso
Q3. Desconecte todos os outros dispositivos para que o instalador não possa ver as outras unidades.
Q4. Use o link que eu forneci nos comentários para fazer um USB inicializável e continue assim.