Se você estiver executando o Raspian, a imagem do Debian para o Raspberry Pi, você pode executar o raspi-config e verificar se o seu Pi está configurado para rodar no modo de desktop, como é o que parece que você está tentando fazer.
sudo raspi-config
do terminal deve fazer o truque. O link abaixo explica como ativar o modo de inicialização:
Eu não acho que é possível ficar no modo 'boot to console' e ainda ser capaz de abrir um aplicativo gui na inicialização, é isso que você está tentando fazer ...
Espero que isso ajude,
nim