Eu não acho que tenha algo a ver com o add-on, mas eu tive um problema semelhante. De alguma forma, o seu sources.list é modificado na linha 2. Faça isso:
Faça uma cópia do seu sources.list, caso precise reverter as alterações:
sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list_backup
Abra o arquivo com um editor, como:
gksu gedit /etc/apt/sources.list
Na segunda linha você encontrará o problema: Essa frase:
See http://help.ubuntu.com/community/UpgradeNotes for how to upgrade to
precisa ser comentado, caso contrário, o gerenciador de atualização tentará lê-lo como uma fonte e esse é o erro que você está vendo.
Basta adicionar um # na frente dessa linha. Eu deveria aparecer assim:
# See http://help.ubuntu.com/community/UpgradeNotes for how to upgrade to
Se o problema persistir, talvez porque você tenha outras linhas com o mesmo erro, apenas corrija-as. Mas não comente todas as linhas, tente primeiro descobrir quais estão erradas. Execute o gerenciador de atualização toda vez e, se houver um erro, ele informará a linha onde está.
Boa sorte!