Eu tive o mesmo problema usando o WebStorm6 e a solução foi limpar o cache. Verifique link para ver, dependendo do seu SO, a localização da pasta Cache.
Alguém já experimentou isso? Estou executando o PHPStorm no modo de 32 bits, mas ainda leva cerca de 7 minutos para inicializar totalmente em um 2.2GHz i7 com 10GB de memória.
Isso parece altamente irregular.
Todos os ponteiros seriam muito apreciados.
Eu tive o mesmo problema usando o WebStorm6 e a solução foi limpar o cache. Verifique link para ver, dependendo do seu SO, a localização da pasta Cache.