Não está claro qual formato de arquivo você usou para armazenar o texto e qual aplicativo é usado para exibir o conteúdo desse arquivo. Como regra geral, você deve garantir que a codificação de caracteres do texto corresponda à codificação esperada pelo programa e também que a fonte usada suporte todos os caracteres necessários. Se você disser que apenas alguns dos personagens parecem estranhos (aqueles com algum tipo de diacríticos, eu assumo: ĄĄĘŁŃŚŹŻąŚŹŻąźżźżźż) é mais provável que uma das duas partes use o UFT-8 e o outro um específico code page , como ISO8859-2 ou Windows-1250. Se houvesse um problema com a fonte, o efeito mais provável seria que espaços reservados (quadrados vazios) fossem exibidos, e eu entendo que isso não é o caso aqui. (Mais poderia ser dito se você deu exemplos específicos de um caso de texto esperado e exibido)