Você provavelmente já tentou muito isso, mas eu vou ir do zero para ter certeza de que nada será perdido.
1) Verifique se a porta funciona. Conecte outro dispositivo USB, de preferência algo com armazenamento para que você possa testar as transferências.
2) Teste ou substitua o cabo USB para descartá-lo.
3) Procure no seu gerenciador de dispositivos. (Painel de Controle > Sistema e Segurança > Gerenciador de Dispositivos). Provavelmente é onde você encontrará o dispositivo fazendo algo estranho.
Eu suspeito que a placa de interface em sua unidade externa esteja ruim, mas a única maneira segura de testar isso é tirar a unidade do gabinete e conectá-la a um controlador em bom estado.