Acho que encontrei uma maneira de fazer isso sem muito software extra. Na minha máquina, pelo menos, todos os arquivos e pastas na área de trabalho já aparecem no menu suspenso de preenchimento automático. Se você criar atalhos para suas pastas e colocá-los na pasta da área de trabalho, eles serão exibidos no menu suspenso de preenchimento automático.
O único problema com isto é que ele irá preencher sua pasta desktop, então se você usar muito a pasta desktop e mostrar arquivos ocultos, isso pode ser inconveniente. De qualquer forma, se isso não for um problema, aqui está um script autohotkey que deve criar automaticamente atalhos ocultos para cada pasta em uma unidade. Você pode usar o planejador de tarefas do Windows para executá-lo automaticamente.
Loop, D:\*, 2, 1
{
FileDelete, %A_Desktop%\%A_LoopFileName%.lnk
FileCreateShortcut, %A_LoopFileFullPath%, %A_Desktop%\%A_LoopFileName%.lnk
FileSetAttrib, +H, %A_Desktop%\%A_LoopFileName%.lnk
}
Substitua 'D' pelo drive de sua preferência. Se você não quiser que os atalhos sejam ocultos, remova a linha FileSetAttrib. Outra consideração é se sua unidade é grande ou contém arquivos de sistema, talvez você não queira atalho tudo, devido a considerações de desempenho. Para reduzir o escopo (talvez apenas documentos), insira outro caminho em vez de "D: \".