Ambos ConEmu e Console2 pode fazer o que você quiser.
No ConEmu, configure um Grupo de Tarefas e adicione guias a esse grupo de tarefas. Você pode personalizar o
diretório de inicialização para cada guia. Em seguida, vá para o Starup
config e defina esse grupo de tarefas como o grupo de tarefas nomeado para carregar na inicialização.