Monte a unidade no CrunchBang e copie os dados que você deseja salvar em uma unidade diferente.
Depois, estabeleça qual é o seu palito. Provavelmente será sda1 - mas cheque de qualquer maneira, olhando os resultados do seguinte comando (você precisa ser root para fazer isso):
fdisk -l
Supondo que seja sda1, você precisará desmontar o disco flash, então:
umount /dev/sda1
Uma vez feito, digite o seguinte comando para formatar o dispositivo flash para FAT32
mkdosfs -F 32 -I /dev/sda1
Se você não estiver confortável com a linha de comando, poderá sempre ativar o GParted. Se não estiver instalado, sudo apt-get install gparted
deve fazer o truque.