Acho que você respondeu sua própria pergunta. A área de trabalho só pode carregar em cerca de 75% (base teórica da velocidade do fuso) como o laptop. O sistema operacional deve ser carregado de disco, para RAM e CPU, o que realmente faz a diferença e é por isso que eu só uso unidades de 7.200 RPM ou mais rápidas em meus desktops e laptops (ou SSD).
Outro pensamento, você mencionou o POST sendo mais rápido, o laptop suporta UEFI, está habilitado? O Windows 8 pode fazer todos os tipos de dispositivos de bruxaria do tipo de hibernação que o laptop pode aproveitar se tiver UEFI e a área de trabalho não.