Se eu entendi corretamente, você está usando o multi boot no seu computador, e agora você quer rodar o seu já existente Instalação do Ubuntu dentro de uma máquina virtual.
Aparentemente, isso é possível com o VMware. Veja se este é de alguma ajuda para você. A partir deste segundo hiperlink:
Many users install VMware Workstation on a dual-boot or multiple-boot computer so they can run one or more of the existing operating systems in a virtual machine. If you are doing this, you may want to use the existing installation of an operating system rather than reinstall it in a virtual machine.