Todo navegador (incluindo o Internet Explorer 6) tem configurações de fonte padrão. Por exemplo, no Firefox está em opção, conteúdo. (terceira guia)
Isso acontece quando o webmaster não definiu uma fonte na página.
Alguns navegadores não oferecem opções, têm fontes predefinidas para a página.
O Chrome não substituirá nenhum site de fontes.
O que talvez você tenha é um problema quando você instala fontes "complexas" como a Helvetica neue com todas as suas 51 variantes no Windows - a renderização da fonte mudará muito nos navegadores.